La réforme du bac général et technologique initiée par le ministère de l'éducation nationale est appliquée dans l'enseignement agricole depuis la session 2021. Structurellement, le bac général de l'enseignement agricole garde sa cohérence en demeurant résolument tourné vers les sciences. Guadeloupe Agro-Campus, à l'instar de l'enseignement public agricole, propose ainsi les 3 enseignements de spécialité suivants en classe de Première: Biologie-Ecologie, Mathématiques et Physique-Chimie. Les enseignements en mathématiques et Physique-Chimie sont en tous points identiques à ce que propose l'Education Nationale. La spécialité Biologie-Ecologie est quant à elle tout à fait spécifique à l'enseignement agricole et se base sur la connaissance scientifique et le fonctionnement des systèmes vivants abordés par des problématiques écologiques et biologiques. Il vise ainsi à enrichir la culture scientifique de l'élève tout autant qu'à développer son esprit critique et son implication citoyenne.

Guadeloupe Agro-Campus propose également aux lycéens engagés dans la filière générale des enseignements optionnels spécifiques tels que l'hippologie et "Agronomie, Economie et Territoire". Il est également possible de suivre l'enseignement optionnel "éducation physique et sportive" selon les mêmes modalités définis par l'Education Nationale. En outre, pour la classe de terminale, les élèves peuvent enrichir leurs parcours avec un second enseignement optionnel ( l'option "Maths complémentaires") tout en poursuivant leurs cursus de spécialités engagés dès la Première (Biologie-Ecologie/ Physique-Chimie).